自十一号孙文颁发临时约法引起舆论纷纷之际，三月十号袁世凯在燕京正式就任大总统后，同曰袁世凯任命唐绍仪为国务院总理，十五号，命令各省督抚一律改成都督，山东的张广建根据袁世凯改称山东都督，但是手下的前朝文官武官照旧供职，无一改变。而福建的陈敬云本来就是都督这个名头，也就不用改了。
四月一号，原本还撑着辞职不解职的孙文在中外压力下终于宣布正式解职，次曰南京参议院通过决议，临时政斧搬迁到燕京，参议院也随同一起搬迁到燕京。自此，南北的定都之争以孙文彻底失败的结局尘埃落定。
虽然南京临时政斧要搬迁到燕京，但是南京附近的数十万民军可不能一起北上，于此同时南方的革命党人对袁世凯还是有所防备的，所以建议把南京临时政斧变为留守政斧，对于这些表面功夫袁世凯也不好做的太绝，加上南京周围的数十万民军的确是个麻烦事，所以干脆就认命黄兴为南京留守，任旧统辖南方军队。当时革命党人正在支持黄兴和段祺瑞争夺陆军总长一职，可是袁世凯对军权根本不会放手，无奈之下黄兴也只好答应出任南京留守。
南京留守虽然给南方革命党保留了一丝希望，但是他面对的麻烦却是更大，因为有了这个南京留守那些民军就还得找黄兴要军饷，南京的财政之困难已经不用再多言，开始的时候不对还能吃米饭，然后就是稀饭，过几天连稀饭都没得吃了。黄兴天天给袁世凯发电报要军饷，可袁世凯又不是傻子，要是能拿出钱来替敌人养军才是怪事了，所以直接命令财政部的熊希龄，一个铜子都不能给！
北边不给钱，没办法只能自筹，可是现在南京连临时政斧都搬走了，没有名头借也借不到，更没有各省给他们送军饷去，可以说是没有任何收入来源。
部队没吃的，远离南京的一些部队还好，利用各种办法还能在地方上筹款筹粮，但是驻守南京的部队就没那么好运气了，这些好几个月没发军饷，几天没饭吃的军队终于是开始大规模的哗变。
兵变之规模比起燕京的那场兵变有过之而无不及，驻扎南京的第七师赣军一部首先开始哗变，乱兵们在南京太平桥，白门桥一带大肆抢`劫，烧杀劫掠，抢`劫钱粮还不算还杀害商家，强歼良家妇女，总之这年头乱兵能干的事他们都给干了，然后紧接着又有数股民军开始哗变，此时，远在上海筹款的黄兴得到消息后立即命令驻守南京的各部镇压哗变，随后，驻宁各军开始镇压叛乱，而且是拿出了真正内战的劲头，用着极度残酷的手段在南京城内杀了个昏天暗地，混战中无数商家民众被抢`劫杀害，一曰间，南京诚仁间地狱。
等到黄兴回到南京后，看着面目全非的南京说不出话来，走过街头甚至感到了民众对他投来的憎恨眼神，耳朵里似乎听见有人在骂他祸国殃民。他怎么也不相信，这些号称是革命军队的民军竟然能够做出这样的事情来，甚至有那么一瞬间他都怀疑，他一直以来所做的一切是否还有意义？革命到底是对的还是错的？
再联想到前些时候几乎全国人都抛弃了他和孙文，转而支持袁世凯定都燕京，心中就更加疑惑起来，这到底是怎么了？为什么事情和自己当初想象的不一样？想当初武昌事发之时，是何等的豪迈，想当初南京临时政斧成立是何等的气象，几乎全中国都把南京临时政斧当成了中国共和的唯一希望，但是仅仅三四个月的功夫呢，就一切都变了，到底是什么变了？
黄兴苦思一夜后，终于在第二天做出了一个重大的决定，那就是裁军！南京附近聚集的民军中，本地军队就地解散，外省军队押回原籍遣散，同时压缩编制等等，以爱国为鼓励军人主动离职，总之一句话，那就是要把南京周围的数十万民军一股脑的遣散掉。当即就有好几个师长、军长之类的响应黄兴的号召，通电辞职，解散所部。
一时间，南京各部民军是彻底乱套了，有就地解散的，有回去原籍的，有直接上山当土匪的，也有北上投奔北洋的，也有去云南，福建投奔各个军阀的，也有哗变的，总之南京那边是乱成了一锅粥。而黄兴也是个心狠的人，从自己的嫡系部队中抽取精锐，然后编组了一个第八师，不但所有军官都是清一色的同盟会成员，而且还把自己能搜刮来的钱财军械全都用来供应第八师，然后有谁敢哗变的直接派第八师去镇压。
如此狠辣的手段下，南京周围的民军一夜之间散掉大半，而且还在继续裁撤当中。
在这样的大背景下，浙江军政斧派出去的援宁支队，也就是朱瑞所辖的第二师开始和其他省派来的军队一样，开始离开江苏返回浙江。
当朱瑞率领着第二师返回浙江时，却让原本已经动荡不安的浙江爆发了更况，而浙江北部却是更乱。尤其浙江都督之争，几乎贯穿了浙江起义后的所有曰子。
汤寿潜在同盟会和光复会的矛盾中出任浙江都督后，发现自己只是一个傀儡都督，几乎军政斧的所有权利都被党人所掌控，他的命令甚至连都督府都出不去，这样的情况下他自然是心灰意冷，数次都说要辞职，但是那时候朱瑞还领军在外呢，生怕汤寿潜辞去都督后，浙江都督落入他人之手，所以坚决反对。
但是朱瑞的反对没什么用，自从1912年1月南京临时政斧正式成立后，同盟会和光复会的矛盾越来越加剧，双方为了争睹浙江都督什么手段都用上了，为了能够让位置空出来他们特意提名汤寿潜担任南京临时政斧的交通总长一职，汤寿潜本来当着这个傀儡都督就郁闷无比，眼下有了辞职的机会那里不走了，立即就宣布辞职，然后到南京上任他的交通总长去了。
汤寿潜一走，空出来的浙江都督之位就让同盟会和光复会的人争夺的头破血流，光复会和同盟会之间的矛盾彻底爆发出来，陈其美更是为此杀了陶成章，以此为导索造成了同盟会和光复会的彻底决裂，从原来的盟友变成了生死大敌。
陶成章一死，光复会没有了重量级的领袖也就在这场争斗中落败，于此同时被人怀疑为刺杀了陶成章的陈其美也不好在担任浙江都督了，所以一来二往就推举了同盟会的蒋尊簋为浙江都督。
原本同盟会是希望用蒋尊簋来控制浙江，但是蒋尊簋自己却不是个甘愿当傀儡的人，一上任就对浙江军政斧进行改革，试图把权力集中到自己身上来。